Я создаю функцию, которая вычисляет радиальное среднее значение и медиану повторного набора для каждого бина и проверяет его на одно изображение в формате * .tif.
import numpy as np
from math import fabs
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.image as mpimg
from PIL import Image
from scipy import stats
def av_radial_profile(data, center):
y, x = np.indices((data.shape))
r = np.hypot(x - center[0],y - center[1])
r = r.astype(np.int)
b = len(set(r.ravel()))
av_radialprofile = stats.binned_statistic(r.ravel(), data.ravel(), statistic ='mean', bins = b)[0]
median_radialprofile = stats.binned_statistic(r.ravel(), data.ravel(), statistic = lambda q: np.nanmedian(q), bins = b)[0]
return median_radialprofile, av_radialprofile
img = mpimg.imread('test.tif',0)
center, radi = (509, 546), 55
rad2, rad3 = av_radial_profile(img, center)
Изображение здесь 
После запуска этого кода у меня появляется следующее предупреждение:
~miniconda3/lib/python3.7/site-packages/scipy/stats/_binned_statistic.py:607: FutureWarning: Using a non-tuple sequence for multidimensional indexing is deprecated; use `arr[tuple(seq)]` instead of `arr[seq]`. In the future this will be interpreted as an array index, `arr[np.array(seq)]`, which will result either in an error or a different result.
result = result[core]
Я попытался найти причину проблемы и увидел, что причина может быть в старых версиях пакетов. После этого я обновил все пакеты с помощью conda и снова запустил свой код, но предупреждающее сообщение не исчезло.
Может быть, кто-то сталкивался с такой же проблемой. Я буду очень благодарен за любую помощь и замечания относительно моего кода.