Вы должны передать apt-get update
в качестве аргумента bash в команде запуска docker.
docker run --rm -it ubuntu:16.04 bash -c "apt-get update"
Для работы с этим
FROM ubuntu:16.04
# Install Packages
RUN apt-get update
Сначала необходимо создать его, а затем теги запустите его.
docker build -t demo/app .
После сборки вам не нужно обновлять сейчас
docker run --rm -it demo/app bash