Как вы запускаете файл R в Ubuntu?

Question

Я попытался запустить файл Rscript с моего терминала Ubuntu на сервере, используя код:

Rscript etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

Файл находится в указанном каталоге ниже, но мне нужно запустить скрипт из корневого каталога. Тем не менее, он говорит, что этот файл не существует, но он явно существует. Я также попытался запустить это, сначала войдя в среду R, но вместо этого я получил:

"Error: Unexpected symbol in "etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

Я следую инструкциям из этого ETL mimic-omoop на github здесь: https://github.com/chichukw/mimic-omop/blob/master/README-run-etl.md, и я уже создалфайл cpg с моим именем пользователя и именем базы данных. Кто-нибудь может уточнить, что я делаю не так?

Answer 1

Попробуйте использовать полный путь к файлу. Отправленная вами ошибка: «Неожиданный символ»

. Возможно, вы добавили двойную кавычку в конце mimiciii. Или это ошибка при публикации вопроса?

Если вы используете двойные кавычки для пути, убедитесь, что это "а не".