Python пул не работает в Windows, но работает в Linux - PullRequest
0 голосов
/ 04 ноября 2019

Я пытаюсь использовать многопроцессорную обработку Python с использованием Python 3.7.4 в Windows 10, процессор Intel Core i7-8550U.
Я тестирую многопроцессорную обработку с двумя функциями, одна с базовым сном (), а другая с использованием matthews_corrcoef изsklearn. Многопроцессорная обработка работает с функцией сна, но не с функцией sklearn.

import numpy as np
from sklearn.metrics import matthews_corrcoef
import time
import concurrent.futures
from multiprocessing import Process, Pool
from functools import partial
import warnings
import sys

class Runner():
  def sleeper(self, pred, man, thr = None):
    return time.sleep(2)

  def mcc_score(self, pred, man, thr = None):
    warnings.filterwarnings("ignore")
    return matthews_corrcoef(pred, man)

  def pool(self, func):
    t1 = time.perf_counter()
    p = Pool()
    meth = partial(func, pred, man)
    res = p.map(meth, thres)
    p.close()

    t2 = time.perf_counter()
    print(f'Pool {func.__name__} {round((t2-t1), 3)} seconds')

  def vanilla(self, func):
    t1 = time.perf_counter()
    for t in thres:
      func(pred, man)
    t2 = time.perf_counter()
    print(f'vanilla {func.__name__} {round((t2-t1), 3)} seconds')

if __name__== "__main__":
    print(sys.version)
    r = Runner()
    thres = np.arange(0,1, 0.3)
    print(f"Number of thresholds {len(thres)}")
    pred = [1]*200000
    man = [1]*200000
    results = []

    r.pool(r.mcc_score)
    r.vanilla(r.mcc_score)

    r.pool(r.sleeper)
    r.vanilla(r.sleeper)

В Windows для функции mcc_score использование пула на самом деле медленнее, чем ванильной версии, тогда как в Linux оно работает должным образом.

Вот пример выходных данных

#windows
3.7.4 (default, Aug  9 2019, 18:34:13) [MSC v.1915 64 bit (AMD64)]
Number of thresholds 4
Pool mcc_score 3.247 seconds
vanilla mcc_score 1.591 seconds
Pool sleeper 5.828 seconds
vanilla sleeper 8.001 seconds

#linux
3.7.0 (default, Jun 28 2018, 13:15:42) [GCC 7.2.0]
Number of thresholds 34
Pool mcc_score 1.946 seconds
vanilla mcc_score 8.817 seconds

Я изучил документацию и другие соответствующие вопросы в stackoverflow, где в основном говорится с использованием if __name__== "__main__":. Некоторая помощь будет принята с благодарностью, так как я застрял на этом довольно долгое время. Если я пропустил какую-либо важную информацию, пожалуйста, укажите ее, я предоставлю ее.

1 Ответ

0 голосов
/ 10 ноября 2019

Во-первых, я собираюсь упростить ваш код. Поскольку методы в вашем классе никогда не используют переменные класса, я пропущу подход к классу и буду использовать только методы.

Отправной точкой является пример из документации для многопроцессорная обработка . Чтобы увидеть выгоду от использования Pool, я добавляю две секунды сна и печатаю метку времени.

import datetime
from multiprocessing import Pool
import time

def fx(x):
    time.sleep(2)
    print(datetime.datetime.utcnow())
    return x*x

if __name__ == '__main__':
    with Pool() as p:
        print(p.map(fx, range(10)))

Вывод соответствует ожидаемому

2019-11-10 11:10:05.346985
2019-11-10 11:10:05.363975
2019-11-10 11:10:05.418941
2019-11-10 11:10:05.435931
2019-11-10 11:10:07.347753
2019-11-10 11:10:07.364741
2019-11-10 11:10:07.419707
2019-11-10 11:10:07.436697
2019-11-10 11:10:09.348518
2019-11-10 11:10:09.365508
[0, 1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]

Поскольку я не указалколичество ядер, все доступные ядра используются (на моей машине 4). Это видно по меткам времени: 4 метки времени находятся рядом друг с другом. Затем исключение приостанавливается до тех пор, пока ядра не будут снова освобождены.

Вы хотите использовать метод matthews_corrcoef, который принимает в соответствии с документацией два аргумента y_true и y_pred.

Прежде чем использовать этот метод, давайте изменим тестовый метод сверху, чтобы принять два аргумента:

def fxy(x, y):
    time.sleep(2)
    print(datetime.datetime.utcnow())
    return x*y

Из документации для multiprocessing.pool.Pool мы узнаем, что map принимает только один аргументПоэтому я собираюсь использовать apply_async вместо этого. Поскольку apply_async возвращает объекты результата вместо возвращаемых значений метода, я использую список для хранения результатов и получения возвращаемых значений в отдельном цикле, подобном следующему:

if __name__ == '__main__':
    with Pool() as p:
        res = []
        for i in range(10):
            res.append(p.apply_async(fxy, args = (i, i)))
        for item in res:
            print(item.get())

Это дает аналогичный выводк первому подходу:

2019-11-10 11:41:24.987093
0
2019-11-10 11:41:24.996087
1
2019-11-10 11:41:25.008079
2019-11-10 11:41:25.002083
4
9
2019-11-10 11:41:26.988859
16
2019-11-10 11:41:27.009847
2019-11-10 11:41:27.009847
25
36
2019-11-10 11:41:27.011845
49
2019-11-10 11:41:28.989623
64
2019-11-10 11:41:29.019606
81

Теперь для matthews_corrcoef. Для лучшей проверки результатов (ваши ошибки выброса pred и man при применении к matthews_corrcoef) я использую номенклатуру и значения, как в примере в документации matthews_corrcoef .

import datetime
from multiprocessing import Pool
import numpy as np
from sklearn.metrics import matthews_corrcoef

def mcc_score(y_true, y_pred): 
    print(datetime.datetime.utcnow())
    return matthews_corrcoef(y_true, y_pred)

y_true = [+1, +1, +1, -1]
y_pred = [+1, -1, +1, +1]

if __name__ == '__main__':
    with Pool() as p:
        res = []
        for i in range(10):
            res.append(p.apply_async(mcc_score, args = (y_true, y_pred)))
        for item in res:
            print(item.get())

Результаты ожидаемые:

2019-11-10 11:49:07.309389
2019-11-10 11:49:07.345366
2019-11-10 11:49:07.375348
2019-11-10 11:49:07.393336
2019-11-10 11:49:07.412325
2019-11-10 11:49:07.412325
2019-11-10 11:49:07.412325
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
2019-11-10 11:49:07.420319
2019-11-10 11:49:07.420319
2019-11-10 11:49:07.413325
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
...