Вы можете использовать условную троицу, чтобы заменить пустое значение на пустую строку:
document.getElementById('l2').value = getl2()? getl2() : '';
document.getElementById('l3').value = getl3()? getl3() : '';
Или вы можете использовать ту же логику, чтобы вернуть пустую строку, а не пустое:
function getl3(){
if (localStorage.getItem("user_selected_l3") !== null) {
return localStorage.getItem("user_selected_l3")?
localStorage.getItem("user_selected_l3") : '';
}
}