Проблема при установке пакета R "ld: warning: каталог не найден для опции" - PullRequest
Новая
       33

Проблема при установке пакета R "ld: warning: каталог не найден для опции"

0 голосов
/ 29 октября 2019

Я пытаюсь установить пакет GradientForest в R с помощью 

install.packages("gradientForest", repos="http://R-Forge.R-project.org")

И я получаю эту ошибку 

ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib'
ld: library not found for -lgfortran

Я уже попробовал ответ от эта тема и эта тема .

В соответствии с этими темами я установил gcc, используя 

brew install gcc

, и мой Makevars выглядит как 

## With Rcpp 0.11.0 and later, we no longer need to set PKG_LIBS as there is
## no user-facing library. The include path to headers is already set by R.
#PKG_LIBS = 

## With R 3.1.0 or later, you can uncomment the following line to tell R to 
## enable compilation with C++11 (or even C++14) where available
CXX_STD = CXX17

VER=-9
CC=gcc$(VER)
CXX=g++$(VER)
CXX11=g++$(VER)
CXX14=g++$(VER)
CXX17=g++$(VER)
CFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
CXXFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
FLIBS=-L`gfortran -print-file-name=libgfortran.dylib | xargs dirname`

но, к сожалению, это ничего не меняет в моей ошибке. Моя версия R - 3.6.1, и я использую MacOS Catalina.

Если кто-нибудь сможет мне помочь, я был бы очень благодарен. Спасибо

1 Ответ

0 голосов
/ 29 октября 2019

Ниже приведен фрагмент из официальных документов R о том, как установить R на Mac, и связанные с этим ошибки: 


CC = /usr/local/clang7/bin/clang
CXX = /usr/local/clang7/bin/clang++
CXX11 = $CXX
CXX14 = $CXX
CXX17 = $CXX
CFLAGS = -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion -Wno-sign-conversion
CXXFLAGS = -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion -Wno-sign-conversion
CXX11FLAGS = $CXXFLAGS
CXX14FLAGS = $CXXFLAGS
CXX17FLAGS = $CXXFLAGS
and gfortran by (El Capitan)

FC = /usr/local/gfortran/bin/gfortran
FLIBS = -L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0
  -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm
or (Sierra or High Sierra)

FC = /usr/local/gfortran/bin/gfortran
FLIBS = -L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin16/6.3.0
  -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm
or (Mojave or later)

FC = /usr/local/gfortran/bin/gfortran
FLIBS = -L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin18/8.2.0
  -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm
(with lines broken here for legibility).

If using the C/C++ compilers from the Command Line Tools (which do not have OpenMP support) one will need to include

SHLIB_OPENMP_CFLAGS =
SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS =

Для получения дополнительной информации перейдите по ссылке ниже, приведенной в 6.3.2

https://cran.r -project.org / doc / manual / r-patched / R-admin.html

Это может помочь вам.

...