У вас не должно возникнуть проблем с использованием клиента SVN 1.6.5 с репозиторием 1.4.2. Единственный раз, когда у вас возникнут проблемы, это использование двух разных версий SVN client .
Ваша рабочая копия будет непригодна для клиента 1.4.2 после ее использования клиентом 1.6.5. Это не повреждает SVN, хотя ... это влияет только на рабочую копию (и она не «повреждена», просто поддерживается таким образом, что клиент 1.4.2 не понимает).