Проблема
Документация для функции readMat() гласит: «Для формата MAT v5 структуры ячеек считываются в R как структура списка.»
Это создает проблему для меняпоскольку я не могу преобразовать его обратно в исходную структуру таблицы из объекта списка. В исходных файлах, которые я унаследовал, каждая строка (а не столбец) представляет ответы на разные вопросники (строка1 = вопросник1, строка2 = вопросник2 и т. Д.), Но способ readMat() создает список по вертикали (по столбцам), поэтому мойВсе элементы анкеты в основном все перепутали.
Код для желаемого результата
Вот код для воспроизведения упрощенного примера желаемого результата и внешнего вида файла в структуре Matlab cell:
list1 <- list("2", "34", "17", NA, NA, NA)
list2 <- list("32", "43", NA, NA, NA, NA)
list3 <- list("C", "D", "A", "F", "G", "I")
list4 <- list("455", NA, NA, NA, NA, NA)
df <- data.frame()
df <- rbind(df,list1,list2,list3,list4)
colnames(df) <- NULL
rownames(df) <- NULL
df
Это выводит следующее ( Желаемая выходная / оригинальная структура MATLAB ):
1 2 34 17 <NA> <NA> <NA>
2 32 43 <NA> <NA> <NA> <NA>
3 C D A F G I
4 455 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
Таким образом, я могу выбирать по строке, вместо того, чтобы иметь беспорядочный порядокнаблюдения. Обратите внимание, что я заменил значения NULL на NA для этого примера, иначе у меня возникла ошибка при создании фрейма данных.
Код для нежелательного вывода
Однако для воспроизведения результатаимпортируя в R из Matlab с readMat() нам нужен здоровенный код, подобный этому:
list1 <- list(matrix("2"))
list2 <- list(matrix("32"))
list3 <- list(matrix("C"))
list4 <- list(matrix("455"))
list5 <- list(matrix("34"))
list6 <- list(matrix("43"))
list7 <- list(matrix("D"))
list8 <- NULL
list9 <- list(matrix("17"))
list10 <- NULL
list11 <- list(matrix("A"))
list12 <- NULL
list13 <- NULL
list14 <- NULL
list15 <- list(matrix("F"))
list16 <- NULL
list17 <- NULL
list18 <- NULL
list19 <- list(matrix("G"))
list20 <- NULL
list21 <- NULL
list22 <- NULL
list23 <- list(matrix("I"))
list24 <- NULL
(mylist <- list(list1, list2, list3, list4, list5,
list6, list7, list8, list9, list10,
list11, list12, list13, list14, list15,
list16, list17, list18, list19, list20,
list21, list22, list23, list24))
, который выводит следующее:
[[1]]
[[1]][[1]]
[,1]
[1,] "2"
[[2]]
[[2]][[1]]
[,1]
[1,] "32"
[[3]]
[[3]][[1]]
[,1]
[1,] "C"
[[4]]
[[4]][[1]]
[,1]
[1,] "455"
[[5]]
[[5]][[1]]
[,1]
[1,] "34"
[[6]]
[[6]][[1]]
[,1]
[1,] "43"
[[7]]
[[7]][[1]]
[,1]
[1,] "D"
[[8]]
NULL
[[9]]
[[9]][[1]]
[,1]
[1,] "17"
[[10]]
NULL
[[11]]
[[11]][[1]]
[,1]
[1,] "A"
[[12]]
NULL
[[13]]
NULL
[[14]]
NULL
[[15]]
[[15]][[1]]
[,1]
[1,] "F"
[[16]]
NULL
[[17]]
NULL
[[18]]
NULL
[[19]]
[[19]][[1]]
[,1]
[1,] "G"
[[20]]
NULL
[[21]]
NULL
[[22]]
NULL
[[23]]
[[23]][[1]]
[,1]
[1,] "I"
[[24]]
NULL
Так что в других темах большинство людейсказал unlist , но отсутствие моего списка не позволяет мне, например, выбирать вопросники по строкам (тем более, что значения NULL не сохраняются в измерениях при выводе из списка):
unlist(mylist)
[1] "2" "32" "C" "455" "34" "43" "D" "17" "A" "F" "G" "I"
Вы можете видеть, что он более аккуратный, но элементы расположены не в правильном порядке, поэтому трудно поместить их обратно во фрейм данных. Некоторые говорили, что превращаются в матрицу ... которая на самом деле не решает проблему:
matrix(unlist(mylist))
[,1]
[1,] "2"
[2,] "32"
[3,] "C"
[4,] "455"
[5,] "34"
[6,] "43"
[7,] "D"
[8,] "17"
[9,] "A"
[10,] "F"
[11,] "G"
[12,] "I"
Я пробовал другие решения из потоков безрезультатно, например:
do.call(rbind.data.frame, mylist) # doesn't work
as.data.frame(matrix(unlist(mylist),nrow=length(mylist),byrow=TRUE)) # doesn't work
Вот несколько связанных тем: 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 и 8 .
Вопрос
Почему для readMat() необходимоимпортировать MAT v5 форматировать структуры ячеек в виде списков, а не фреймов данных (это избавило бы нас от многих проблем)?
Я ищу решение в идеале в базе R для преобразованиясписок readMat() для фрейма данных, который я мог бы автоматизировать, если бы у меня было тысячи таких файлов, которые я не собираюсь редактировать, реструктурировать или сохранять в другом формате по отдельности в Matlab, и предполагая количество и местоположение *Различаются значения 1078 *, а также длина каждой строки (некоторые анкеты содержат больше элементов, чем другие). Спасибо!