Очень быстрый ответ без пакетов, составьте таблицу, чтобы узнать, есть ли у каждого человека CD4 или моноциты
table(df[,1],df[,2])
CD4 T-cells Monocytes
IGTB10 1 1
IGTB100 1 0
IGTB1004 1 0
IGTB1007 1 0
IGTB1009 0 1
Если взять сумму строк,
rowSums(table(df[,1],df[,2]))
IGTB10 IGTB100 IGTB1004 IGTB1007 IGTB1009
2 1 1 1 1
Только IGTB10имеет 2, что означает и CD4, и моноцит
Если мы будем использовать весь код подряд,
sum(rowSums(table(df[,1],df[,2]))==2)
Только у одного человека есть и CD4, и моноциты