Решение было объединено - загрузка файлов свойств была сделана с InputStreamReader, который использовал набор символов UTF8-
inStream = javaio.FileInputStream(propsFil)
instreader = javaio.InputStreamReader(inStream, "UTF8")
propFil = util.Properties()
propFil.load(instreader)
После этого мне нужно было использовать AdminTask вместо AdminConfig-
AdminTask.setJVMSystemProperties('[-serverName '+ server + ' -nodeName '+ node+ ' -propertyName '+ config_property +' -propertyValue ' + config_value + ' ]')