Для MySQL я создал сигнал, который делает это после syncdb:
from django.db.models.signals import post_syncdb
from project.app import models as app_models
def auto_increment_start(sender, **kwargs):
from django.db import connection, transaction
cursor = connection.cursor()
cursor = cursor.execute("""
ALTER table app_table AUTO_INCREMENT=2000
""")
transaction.commit_unless_managed()
post_syncdb.connect(auto_increment_start, sender=app_models)
После syncdb выполняется оператор alter table. Это освободит вас от необходимости входить в mysql и выдавать его вручную.
РЕДАКТИРОВАТЬ: Я знаю, что это старая тема, но я подумал, что это может кому-то помочь.