Как заставить IntelliJ распознавать «исключающие» файлы в плагине Gradle ShadowJar при отладке?

Question

Я хочу отладить свое Java-приложение, которое управляется Gradle и упаковано плагином Gradle shadowJar. Я исключаю некоторые файлы в задаче shadowJar в build.gradle, однако эти файлы не исключаются при запуске отладки в IntelliJ. Так есть ли способ сказать IntelliJ исключить эти файлы при отладке? Я уверен, что мой код в build.gradle правильный, потому что я могу использовать командную строку для сборки правильного пакета jar.

apply plugin: 'application'
apply plugin: 'com.github.johnrengelman.shadow'
shadowJar {
    zip64 true
    exclude 'config/audit.yml'
    exclude 'config/body.yml'
    exclude 'config/client.yml'
}