Обсуждается этот вопрос на форуме DataTables: https://datatables.net/forums/discussion/58440
Обновление (на основе комментариев):
Файл cookie исходит от поставщика DataNables CDN Cloudflare, а не от самих DataTables. (имя файла cookie "__cfduid"). Первоначальное тестирование в Chrome с включением # same-site-by-default-cookies показывает, что это не должно оказать заметного влияния на DataTables.
У DataTables есть билет, открытый с Cloudflare. Проверьте наличие обновлений на форуме.