при указании keep_default=False
все значения по умолчанию не рассматриваются как нан, поэтому вы должны указать их:
использовать keep_default_na=False, na_values= [‘’, ‘#N/A’, ‘#N/A N/A’, ‘#NA’, ‘-1.#IND’, ‘-1.#QNAN’, ‘-NaN’, ‘-nan’, ‘1.#IND’, ‘1.#QNAN’, ‘N/A’, ‘NULL’, ‘NaN’, ‘n/a’, ‘nan’, ‘null’]