Различный размер не будет проблемой, однако есть некоторые ошибки, когда дело доходит до использования нескольких каталогов для data_file_directories. Я бы посоветовал вам прочитать блог TLP , в котором освещается большинство из них.
Вкратце, есть ошибки, которые затрагивают использование нескольких каталогов данных в старых версиях cassandra. В более современных версиях все еще есть проблемы, когда удаление одного из каталогов данных может сделать узел нераспознаваемым для остальной части кластера, хотя это не является ошибкой, вы удаляете системные таблицы, в которых хранится информация о членстве в кластере.