Если вы говорите о пустых формах заполнителей, просто используйте макет слайда, который не имеет заполнителей.
В шаблоне по умолчанию, который используется, когда вы вызываете Presentation()
сам (без аргумента), то естья верю седьмой макет (prs.slide_layouts[6]
).
Но вам нужно настроить его для любого используемого вами начального файла .pptx (в моем случае «my_pptfile_begin.pptx»), посмотрев его в слайдеосновной вид и обратный отсчет до пустого макета (или добавление одного, если у него его нет).