Быстрый поиск в Stackoverflow дает ответ:
Дамп массива NumPy в CSV-файл
Вставленный здесь код на случай, если ссылка когда-либо умрет:
import numpy
a = numpy.asarray([ [1,2,3], [4,5,6], [7,8,9] ])
numpy.savetxt("foo.csv", a, delimiter=",")
На странице также есть полезные альтернативные способы конвертировать ее с помощью панд.