Лично я бы сделал это с помощью простой выровненной по правому краю вкладки. Это гораздо проще понять, как в кодовой форме, так и после того, как перед вами откроется файл docx в Word.
Итак, если у вас есть страница А4 с полем 2,5 см с каждой стороны, это даету вас ширина 16 см, поэтому поместите вкладку @ 16 см, что-то вроде этого (этот код работает - я только что попробовал):
$phpWord->addParagraphStyle('footer_paragraph', array('tabs' => array(new \PhpOffice\PhpWord\Style\Tab('right', \PhpOffice\PhpWord\Shared\Converter::cmToTwip(16)))));
$footer = $section->addFooter();
$footer->addPreserveText('Page {PAGE} of {SECTIONPAGES}' . "\u{0009}Confidential Document", 'your_own_font_style', 'footer_paragraph');