Я понимаю, что ваши данные составляют 1303 экземпляра размера векторов (3988,1).
Ответ зависит от слоя, который идет после ввода:
Если вы передадите его после Conv1Dслой, так что входной слой должен быть:
Input(3988,1)
В противном случае вы должны сжать слой с:
np.squeeze(your_numpy_array)
или просто сгладить ввод после первого слоя:
x=Input(3988,1)
x=Flatten()(x)