Вы можете сохранить в localStorage, если пользователь отклонил предупреждение о cookie-файле.
При загрузке страницы вы бы проверили, задан ли ключ, и отобразили бы предупреждение, если нет:
if (!localStorage.getItem('cookie-alert-dismissed')) {
$('#cookie-alert').show()
}
и затем добавьте его, когда пользователь закроет предупреждение:
$('#cookie-alert button').click(function() {
$('#cookie-alert').hide()
localStorage.setItem('cookie-alert-dismissed', 1);
});
Этот ключ будет сохраняться до тех пор, пока пользователь не опустошит свой localStorage или не использует другой браузер.