Вы не можете запускать серверы приложений в IntelliJ CE. Вы можете сделать это только в Ultimate Edition.
Для этого: Перейдите в Настройки / Предпочтения IntelliJ -> Перейдите к Application Servers
в разделе Build, Execution, Deployment
-> Нажмите знак плюс, чтобы добавить сервер в среду IntelliJ. Примечание. Обязательно укажите месторасположение сервера лицензий на вашем компьютере.
После того, как вы создали сервер, вы сможете запускать свое Java-приложение через IntelliJ. Я полагаю, что ваша проблема использует IntelliJ CE. Поскольку вы используете CE, вам необходимо запустить сервер приложений через командную строку, так как Community Edition не позволяет выполнять этот уровень функциональности.