Я успешно разместил приложения asp.net core 3.0 на эластичных хостах ian beanstalk, добавив идентификатор времени выполнения в проект, нацеленный на win-x64, как описано в этом сообщении в блоге (я знаю, что это для .NET core 2.1, но то же самое работаетдля .NET core 3.0) https://aws.amazon.com/blogs/developer/net-core-2-1-and-aws/
Надеюсь, это сработает для вас.