Это было проще, чем я предполагал - взять информацию о столбце со страницы настройки slidify вместо создания файла макета столбца, просто добавив
<div class='left' style='float:left;width:48%'>
code or image for left of slide
</div>
<div class='right' style='float:right;width:48%'>
code or image for right
</div>
к слайду в моемФайл уценки slidy_presentation работал отлично.