Общая проблема
Я пытался запустить несколько программ (VisIt и Athena), и у меня возникли похожие проблемы - невозможность найти общие библиотеки, хотя они существуют в другом месте.
Вывод кода / Ошибки
Попытка запустить Athena дает мне
[~athena/working]$ ~/athena/bin/athena -i athinput.blast >log
/nethome/myname/athena/bin/athena: error while loading shared libraries: libhdf5.so.103
или при запуске VisIt
[~/local/visit/bin]$ ./visit
Running: gui3.0.2
/localdata/myname/visit/3.0.2/linux-x86_64/bin/gui: error while loading shared libraries: libGLU.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
То, что я пытался
Если я использую find -iname
, я могу найти обе эти библиотеки
[~/local/anaconda2]$ find -iname 'libhdf5.so.103'
./lib/libhdf5.so.103
./pkgs/hdf5-1.10.4-nompi_h3c11f04_1106/lib/libhdf5.so.103
./pkgs/hdf5-1.10.4-hb1b8bf9_0/lib/libhdf5.so.103
и
[~/local/anaconda2]$ find -iname 'libGLU.so.1'
./lib/libGLU.so.1
./pkgs/libglu-9.0.0-hf484d3e_1/lib/libGLU.so.1
Что мне нужно сделать, чтобы указать на них. Я попытался обновить путь к компилятору, используя export CPATH
, и попытался добавить LDLIBS := -L/nethome/sferrel6/local/anaconda2/lib -lhdf5
в Makefile Athena (который ранее помог мне найти библиотеку hdf5)