Просто это означает, что классы, которые вы пытаетесь экспортировать в jar, имеют предупреждения. Я советую вам перекомпилировать код и сохранить все, затем (если все правильно) попробуйте снова экспортировать файл. В крайнем случае закройте и перезапустите Eclipse и попробуйте снова.