Однострочник awk
awk '!($1 == $3 && $2 == $4 && $3 == $5 && $4 == $6)' file
будет выводить
Symbol Qty Symbol Qty Symbol qty
a 10 a 10 a 11
c 12 c 12 f 12
f 12 f 12 g 13
Вы идете по этому поводу неправильно: вы не можете смешать все файлыв один, а затем попробуйте найти, какие из них имеют разные / пропущенные значения. Вам нужно обработать отдельные файлы
$ cat file1
Symbol Qty
a 10
b 11
c 12
f 12
$ cat file2
Symbol Qty
a 10
b 11
c 12
f 12
$ cat file3
Symbol qty
a 11
b 11
f 13
g 13
Затем при условии, что у вас есть GNU awk
gawk '
FNR > 1 { qty[$1][FILENAME] = $1 " " $2 }
END {
OFS = "\t"
for (sym in qty) {
missing = !((ARGV[1] in qty[sym]) && (ARGV[2] in qty[sym]) && (ARGV[3] in qty[sym]))
unequal = !(qty[sym][ARGV[1]] == qty[sym][ARGV[2]] && qty[sym][ARGV[1]] == qty[sym][ARGV[3]])
if (missing || unequal) {
print qty[sym][ARGV[1]], qty[sym][ARGV[2]], qty[sym][ARGV[3]]
}
}
}
' file{1,2,3}
output
a 10 a 10 a 11
c 12 c 12
f 12 f 12 f 13
g 13