Я работаю над восстановлением леса и хочу проверить влияние трех обработок на видовой состав.
Подводя итог моим данным: у меня есть данные о наличии / отсутствии и численности 34 видов сосудистых растений в 18сайты (ID). На этих участках были применены 3 различных способа обработки (в результате было получено 6 участков в каждом Treatment), и данные были собраны до, сразу после и через 8 лет после (Timeline) обработок, поэтому я также работаю с повторныммеры.
Перед выполнением теста перманова с помощью adonis2() я применил преобразование квадратного корня к своим данным, а затем создал матрицу расстояний, используя vegdist(), метод bray (FL.dist)
Предположение об однородности дисперсии между группами было проверено и выполнено. Для выполнения перманента я использовал следующий код:
FL.div<-adonis2(FL.dist~Treatment+Timeline, data=Permanova_fieldlayer,
permutations = 999,method="bray", strata="ID")
Мой вопрос был бы, рассматривал ли я Timeline как еще один эффект с фиксированным коэффициентом? Как я могу указать, что эту переменную следует использовать в качестве повторяющихся мер?