Перейти к File -> Settings -> Editor -> Inspections. Там есть список всех проверок для разных языков. Перейдите к списку Python и найдите Unresolved references. Установите этот флажок, чтобы включить конкретную проверку.
Примечание : проверки определены только для текущего проекта. Чтобы включить (или отключить) проверку новых проектов, перейдите в настройки на начальном экране PyCharm.