Jupyter - это в основном приложение для браузера, тогда как spyder - это выделенная среда разработки. Когда я работаю с большими наборами данных, я никогда не использую Jupyter, поскольку Spyder, кажется, работает намного быстрее. Единственный способ действительно сравнить это - запустить / запустить один и тот же скрипт на Spyder и Jupyter пару раз, но по моему опыту Spyder всегда побеждает Jupyter, когда дело доходит до времени вычислений.
РЕДАКТИРОВАТЬ: Как @carlos упоминает в своем комментарии: «В принципе и Spyder, и Jupyter используют одну и ту же технологию для запуска вашего кода. Кроме того, у нас есть множество настроек для улучшения взаимодействия с пользователем».
При тестировании я заметил, что jupyter всегда работает медленнее. Я думаю, что это связано с тем, сколько ресурсов ваш компьютер выделяет для браузера по сравнению с IDE.