Первым делом было бы обновление до последней версии, 5.7.0 уже давно, и многие, многие .... многие ошибки были исправлены с тех пор.
Вам необходимо выяснить, что приводит к тому, что данные хранятся в магазине, и все это сводится к тому, как вы используете брокера и как ваши потребители читают и подтверждают (или нет, что, вероятно, так) сообщение, котороепомещаются в очереди брокеров. Одной из распространенных проблем является то, что потребители используют селекторы сообщений, оставляя старые неиспользованные сообщения на посреднике, что приводит к сохранению данных.
На веб-сайте ActiveMQ есть очень хороший фрагмент документации , в которой объясняются шаги по отладке сохранения файла журнала.