Эта строка кода дает мне ошибку. Я проверил, и типы Визит, субъект, A, B и C все целые или двойные.
V1V2 <- cpg.assoc(expr, phenotypes$Visit, chip.id=phenotypes$subject, random=T,covariates=data.frame(phenotypes$A,phenotypes$Bphenotypes$C))
Ошибка в cpg.work (beta.val, indep, covariates, data, logit.transform,: beta.values содержит символы, matrix / data.frame должен быть полностью числовым