Такова природа .RTF (то есть файлов Rich Text), они включают дополнительные данные, чтобы определить, как текст будет размечен и отформатирован.
Не рекомендуется хранить данные в таких файлах, чтобы не столкнуться с трудностями, которые вы отметили. Если вы попытаетесь проанализировать этот файл и «восстановить» однозначное значение, вы можете подвергнуть свое приложение риску обновления версий RTF-формата, что может сделать логику синтаксического анализа частично неверной и, следовательно, привести к неверным числовым данным для приложение).
Почему бы не сохранить эту информацию в текстовом файле. Это может быть простой текстовый файл или, предпочтительно, файл XML, YAML, JSON, например, для добавления «прямой» совместимости в качестве приложения, и вы можете добавить дополнительные параметры и тому подобное в файл.
Однако, если этот файл задан, возможно, существуют библиотеки Python для чтения и записи в него. Проверьте Индекс пакета Python (PyPI) для ключевого слова RTF.