Это зависит от вашей операционной системы, но в Unix будет работать следующий скрипт:
#!/bin/sh
MYSELF=`which "$0" 2>/dev/null`
[ $? -gt 0 -a -f "$0" ] && MYSELF="./$0"
java=java
if test -n "$JAVA_HOME"; then
java="$JAVA_HOME/bin/java"
fi
exec "$java" $java_args -jar ${MYSELF}.jar "$@"
exit 1
Вам необходимо добавить этот скрипт в начале вашего jar с помощью cat, как показано ниже:
cat script.sh my.jar > my-program
И перенесите my-program в какой-нибудь каталог в вашем $ PATH. После этого вы сможете вызывать my-program как обычную программу.