Убедитесь, что вы удалили коммит на вашем локальном компьютере, и принудительно нажмите на основную ветку, чтобы обновить ее в соответствии с вашей локальной веткой, используя
git checkout master; git push -f
При этом,пожалуйста, знайте, что основная ветка на github будет принудительно обновлена вашей локальной веткой. Это не рекомендуемая практика.