Текущий вывод кода
Цель:
Я пытаюсь добавить значения значимости для сравнения сгруппированных участков, т. Е. Сравнить значения для зараженных и неинфицированных. Я хотел бы также опустить аннотацию для незначительных значений.
Текущая ситуация:
Я могу сравнивать разные столбцы, т.е. между FA 16: 0 против 18: 0, но не один и тот же столбец между различными группами, т.е. FA 16: 0 изинфицированные против неинфицированных.
текущий код:
ggplot(data = FA.m, aes(x=variable, y=value)) + geom_boxplot(aes(fill=Group), outlier.size=-1) +
theme(axis.ticks = element_blank(),
axis.text.x = element_text(size=9, angle=),
panel.border = element_blank(),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.background = element_rect(fill = "white", colour = "white",),
legend.title = element_blank()) +
coord_cartesian(ylim = c(14, 21)) +
scale_x_discrete(name ="FA") +
geom_signif(test="wilcox.test",
comparisons = combn(levels(FA.m$variable),2, simplify = F)[-4], map_signif_level = c("***"=0.001, "**"=0.01, "*"=0.05), size = 0)
Я думаю, что этот код мне нужно изменить, но я не уверен ....
comparisons = combn(levels(FA.m$variable),2, simplify = F)[-4]