r ^ 2 Значение индекса LD, когда частота аллеля AB известна - PullRequest
0 голосов
/ 02 ноября 2019

Это второй день, когда я пытаюсь решить японское судоку .

Нужный ответ - значение индекса r ^ 2 LD, округленное до 3 десятичных знаков, когда частота AB равнадо 0,2. Существует два SNV, SNV A и SNV B. Их двумя аллелями являются (A, a) и (B, b). Частота аллеля A составляет 0,2, а одного из B составляет 0,7. Частота АБ при экстремальных ЛД равна 0,2.

Я пытался использовать несколько конфигураций возможных числовых конфигураций в матрице, но до сих пор не пришел правильный ответ. х-квадрат = г ^ 2

Пример кода:

tab<-matrix(c(0.2,0.5,0.5,0), 2,2)
tab
chisq.test(tab,correct=FALSE)
...