Можете ли вы попробовать запустить команды в определенном каталоге пользователя вместо корневого каталога? (например, cd / home / ubuntu)
А также используйте запуск npm без sudo.
Во-вторых, главная проблема, которую я вижу здесь, заключается в следующем: запуск npm не запускает приложения узла вфон. Возможно, вам придется использовать что-то вроде nohup или pm2 (менеджер процессов 2) для решения этой проблемы.