Используйте файл .env через .gitignore, если в обоих случаях вы извлечете его, он не будет передаваться, вы создадите .env в своем проекте, тогда он будет отличаться для обоих проектов.
.env файл для производства
db = mongodb://XX.XXX.XX.XX/zXp
IAM_USER_SECRET = 06VXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXRzC
NODE_ENV = production
.env файл для разработки
db = mongodb://XX.XXX.XX.XX/zXp
IAM_USER_SECRET = 06VXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXRzC
NODE_ENV = development