HTML
<a href="#">click</a>
<div id="bottom-layer" class="bottom-layer"></div>
JS
window.onload = function(){
let element = document.getElementById("bottom-layer");
element.classList.add("active");
};
С jQuery
$(document).ready(function(){
$('#bottom-layer').addClass('active');
})
Если вы хотитечтобы происходить до выгрузки страницы, вы должны создать функцию для каждого клика и установить тайм-аут, например:
Html
<a onclick = "navigate('place-href-here')"></a>
JS
function navigate(href-received-as-argument){
let element = document.getElementById("bottom-layer");
element.classList.add("active");
setTimeout(function() {
window.location.href = href-received-as-argument;
}, 1000);
}