Если возможно получить доступ к этим сервисам из IE, это означает, что сервисы доступны для учетной записи пользователя, которая запускает IE.
Попробуйте установить impersonation = true для приложения asp.net, чтобы оно выполнялось в учетной записи пользователя, вошедшего в систему. Это можно сделать, изменив файл web.config вашего приложения или IIS mmc. См. Справку MSDN, если вы не можете понять, как установить олицетворение = true.