Загрузка отношений из файла tsv не работает на neo4j

Question

Я пытаюсь импортировать отношения из файла tsv в neo4j с более чем 1 000 000 строк. Мне удалось успешно импортировать файл узла с 23 000 узлов за считанные секунды. Тем не менее, когда я пытаюсь импортировать файл отношений tsv, neo4j занимает много времени, вычисляя этот файл (несколько часов) только для того, чтобы сказать: «без изменений не создано никаких отношений». Я не знаю, правильно ли я это делаю, потому что я довольно новичок в neo4j.

Я использую версию сообщества neo4j.

The node file that is imported into neo4j looks like this: 

id      name    kind
Anatomy::UBERON:0000002 uterine cervix  Anatomy
Anatomy::UBERON:0000004 nose    Anatomy
Anatomy::UBERON:0000006 islet of Langerhans Anatomy

The relationship file looks like: 

source  metaedge    target
Gene::801       GiG     Gene::7428
Gene::5987      GiG     Gene::9412
Gene::5747      GiG     Gene::79738



//how im trying to link the relationships

using periodic commit 
LOAD CSV WITH HEADERS FROM 'file:///edges.tsv' as edges FIELDTERMINATOR'\t' 
MATCH (a:myNodes{name:edges.source})
MATCH(b:myNodes{name:edges.target})
CREATE (a)-[:CONNECTED{metaedge:edges.metaedge}]->(b)    


Don't know how to make this work and speed up the process as well.

Answer 1

С помощью
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ PERIODIC COMMIT вы должны указать значение

Это значение зависит от наличия оперативной памяти для Neo4j. Это значение может быть установлено в neo4j.conf

Кроме того, есть ли у вас ограничения unicity для имени для myNodes?

Я бы посоветовал запускать импорт не из веб-приложения, а из CLI,И запустить автономный сервер (не настольный компьютер), если у вас ограничено ОЗУ

Запуск другого инструмента для просмотра загрузки ОЗУ, загрузки ЦП, загрузки диска может помочь вам найти правильные настройки для импорта.