Я думаю, что вам, возможно, понадобится создать резервную копию файла, который у вас есть на вашем локальном компьютере, а затем взять и добавить файл, который у вас есть, в локальный компьютер и отправить его в репо. Не уверен, что его можно напрямую восстановить с github.