Пожалуйста, ознакомьтесь с официальной документацией ниже, объясняющей компоненты App Engine ссылка :
Приложение App Engine состоит из одного ресурса приложения, который состоит из одного илибольше услуг. Каждый сервис может быть настроен на использование разных сред выполнения и работу с разными настройками производительности. В каждом сервисе вы развертываете версии этого сервиса. Затем каждая версия запускается в одном или нескольких экземплярах, в зависимости от того, какой объем трафика вы настроили для обработки.
В облачной консоли Google вы можете удалить службу;удалить, остановить, запустить версию сервиса;удалить экземпляр версии. Поэтому я думаю, что вы должны остановить версию своего сервиса.