Возможно, вы могли бы показать суть того, что вы делаете? В частности, что вы подразумеваете под "уничтожить старого"?
Здесь используется jQuery, но вы можете написать код на голое железо, если хотите:
var item = $('#item-id'); // item to move
var want = $('#new-div'); // container to receive it
item.remove();
want.append(item);
У вас могут быть проблемы с перемещением iframes (не уверен). Если это так, и если вы просто меняете два элемента, переместите другой.