Функция StgCreateStorageEx создает новый объект хранения с использованием интерфейса IStorage. Это позволяет хранить несколько объектов данных в одном двоичном файле, например, https://en.wikipedia.org/wiki/COM_Structured_Storage. Таким образом, технически вы можете сохранить в этом файле практически все, включая встроенные свойства.
Не думаю, что этоограничен NTFS: старый формат Microsoft Office .doc (и многие другие продукты Microsoft) используют этот формат хранения и работают также с FAT32.
Если вы хотите использовать этот двоичный формат файла, это совершенно другой вопрос. Поскольку вы не предоставили никакой информации о содержании и формате вашего файла, я не могу ничего рекомендовать. Один из вариантов - хранить содержимое вашего файла в XML-файле. Свойства, такие как Название и Автор, могут быть легко добавлены.