Это может быть меньше памяти, чем преобразование ячейки:
Если ваша структура называется x
,
names = fieldnames(x); % gets the names of the items in the struct
for i = 1:numel(names)
x.(names{i})(x.(names{i})==-9.969209968386869e+36) = nan('single');
end