A Шаблон проекта Visual Studio - это, по сути, просто zip-файл, содержащий пару файлов, которые будут скопированы для любого проекта, созданного с использованием этого шаблона.
Visual Studio не имеет встроенной MongoDBподдержка (хотя VS Code делает). Если вы хотите запускать запросы MongoDB из Visual Studio, вам нужно установить расширение, которое делает это, например Mongo DB Tools (с которым я не связан, и никогда не использовал его),
Так что я сомневаюсь, что вы на самом деле хотите шаблон проекта. Вы можете организовать файлы в любом типе проекта.