Это не имеет ничего общего с питоном. Скорее всего, программа, в которой вы просматриваете .csv, форматирует вывод.
Кроме того, вы уверены, что хотите выводить таким образом? В настоящее время вывод:
1,/,1
1,/,3
Вы можете удалить цикл и просто записать список в файл
import csv
my_list = ["1/1", "1/3"]
with open("my_csv.csv", "a", newline="") as csvfile:
writer = csv.writer(csvfile)
writer.writerow(my_list)
для этого вывода: 1/1,1/3