Вот как можно достичь своей цели:
txt = open('matrix.txt')
matrix = []
for line in txt:
line_list = [l for l in list(line) if l != '\n']
matrix.append(line_list)
print(matrix)
print(matrix[1][1])
Вывод
[['x', 'x', 'x', 'x', 'x'], ['x', 'S', '-', '-', 'x'], ['x', 'x', '-', 'F', 'x'], ['x', 'x', 'x', 'x', 'x']]
S
ОБНОВЛЕНИЕ: список-понимание прост. Но есть и другой способ достичь своей цели.
for line in txt:
line_list = []
for l in list(line):
if l != '\n':
line_list.append(l)
matrix.append(line_list)
print(matrix)
print(matrix[1][1])
Выход
[['x', 'x', 'x', 'x', 'x'], ['x', 'S', '-', '-', 'x'], ['x', 'x', '-', 'F', 'x'], ['x', 'x', 'x', 'x', 'x']]
S