Если я правильно понял ваши варианты использования здесь, я бы порекомендовал запустить два отдельных экземпляра Gunicorn / Daphne (или любой другой WSGI / ASGI, который вы используете) и использовать NGINX в качестве прокси для обслуживания приложения Django через разные порты.
Это создаст отдельные области памяти для каждого приложения, а также сделает их отдельными процессами.
Если вы намерены повысить производительность своего приложения, то рабочие Gunicorn будут именно тем, что вы ищете.